医院信息系统的组成主要由硬件系统和软件系统两大部分组成。在硬件方面，要有高性能的中心电子计算机或服务器、大容量的存储装置、遍布医院各部门的用户终端设备以及数据通信线路等，组成信息资源共享的计算机网络；在软件方面，需要具有面向多用户和多种功能的计算机软件系统，包括系统软件、应用软件和软件开发工具等，要有各种医院信息数据库及数据库管理系统。

从功能及系统的细分讲，医院信息系统一般可分成三部分：一是满足管理要求的管理信息系统；二是满足医疗要求的医疗信息系统；三是满足以上两种要求的信息服务系统，各分系统又可划分为若干子系统。此外，许多医院还承担临床教学、科研、社会保健、医疗保险等任务，因此在医院信息系统中也应设置相应的信息系统。

医院信息系统应具备以下基本功能：

（1）收集并永久存储医院所需全部数据。

（2）由于医院信息尤其是病人信息具有动态数据结构和数据快速增加的特性，医院信息系统应具有大容量的存储功能。

（3）数据共享。

（4）要能快速、准确地随时提供医院工作所需要的各种数据，支持医院运行中的各项基本活动。

（5）具有单项事务处理、综合事务处理和辅助决策功能。

（6）具备数据管理和数据通信的有效功能，确保数据的准确、可靠、保密、安全。

（7）为了保证医疗活动和医院动作不间断地运转，系统应具备持续运行的功能。

（8）具有切实有效的安全、维护措施，确保系统的安全性。

（9）具备支持系统开发和研究工作的必要软件和数据库。

（10）具有良好的用户环境，终端用户的应用和操作应简单、方便、易学、易懂。

（11）系统具有可扩展性。

医院信息系统在医院信息化管理中的应用意义如下：

1.就医流程最优化

把优化病人就医流程作为以病人为中心的切入点，充分应用各种成熟技术，如磁卡、条形码，因特网和手机短信等，着力解决诸如门诊“三长一短”等现象。

2.医疗质量最佳化

充分利用系统信息及集成，让医生及时全面了解患者的各种诊疗信息，为快速准确诊断奠定良好基础；并通过各种辅助诊疗系统的开发，来提高检查检验结果的准确及时性。同时，也能把医务人员各种可能的差错降到最低，达到医疗质量最佳化。

3.工作效率最高化

充分利用已有的信息平台，将各种现代通信技术（如PDA）、自动化设备（如自动摆药机）和实验室自动化系统引人医院数字化建设中，减轻工作强度，提高工作效率。

4.病历实现电子化

深刻理解电子病历的内涵，丰富原有病历的内容，把包括CT、MRI、X线、超声、心电图和手术麻醉等影像图片、声像动态以及神经电生理信号等全新的信息记录在案，使病历更加直观和全面，确保医疗信息的完整性。

5.决策实现科学化

通过建立强大的管理和诊疗数据仓库等系统，使得医院管理和诊疗决策完全建立在科学的基础上，不断提高管理和诊疗决策水平。

6.办公实现自动化

把办公自动化作为医院数字化建设的重要组成部分。突出抓好公文流转办公的自动化和日常工作管理的自动化，基本实现院内公文无纸化和快速传递邮件化。

7.网络实现区域化

针对病人的合理需求，充分利用网络资源来提高医疗质量、降低医疗费用和合理利用医疗资源。把区域医疗信息网络作为医院数字化建设发展的高级阶段进行研究和建设。

8.软件实现标准化

信息标准化是信息集成化的基础和前提，把软件的标准化建设作为医院与国内外接轨的重要保证贯穿始终。包括采用国际或国家统一的信息交换和接口标准和接口代码，如采用HL7、DICOM3.0等医疗信息交换和接口标准，各种代码如疾病、药品和诊疗等代码，采用国际或国家统一的标准代码，医院内部的病人ID号也应尽量采用统一的代码，如身份证号码等。